孫士毅在鎮(zhèn)南關，收容逃回的官兵，不到清軍總額的一半，大量的糧械火藥丟失殆盡。從云南開化廳馬白關出兵，侵入安南宣化鎮(zhèn)的烏大經部，遭到農民起義軍反擊后，也倉慌逃回國內。

安南之役以清朝的失敗而告終。它沒有實現清朝預期的戰(zhàn)略目標“為黎氏復國，消滅阮氏集團?！?/p>

安南之役敗北，大批清朝將士殞命安南。乾隆皇帝令敗將孫士毅解任回京，調?？蛋惭a授兩廣總督，相機辦理安南事宜。

“安南之役”兩國交兵，使清前期的清安關系蒙上了一層陰影。但它并未長久的影響清安關系的正常發(fā)展。隨著兩國政策的逐步調整，很快就驅除了戰(zhàn)爭的陰霾，迎來了兩國關系發(fā)展的燦爛前景。乾隆皇帝決計不再調兵進剿安南。福康安也與乾隆皇帝的想法相吻合。