乾隆五十三年(1788年)農(nóng)歷十月二十八日，孫士毅統(tǒng)兵出關(guān)，一路勢(shì)如破竹，各守隘軍隊(duì)望風(fēng)奔遁，阮惠惟扼三江之險(xiǎn)，以拒清軍。十一月十三日五鼓，清軍抵達(dá)壽昌江北岸，阮軍退守南岸。清軍發(fā)起猛攻，乘筏直沖。濃霧彌漫，昏暗不辨敵我。阮軍于霧中自相格殺。清軍乘勢(shì)全部渡江。十五日，清軍進(jìn)軍至市球江。市球江江面寬闊，且南岸依山，地勢(shì)高于北岸。阮軍據(jù)險(xiǎn)列炮，守御甚固。清軍進(jìn)攻受阻。

為迷惑阮軍，清軍伐運(yùn)竹木，于正面搭建浮橋作欲渡之象，同時(shí)派兵二千潛行至上游二十里處宵濟(jì)。十七日，于上游渡江的清兵已繞至阮軍背后，乘高大呼下?lián)?，正面清軍乘?shì)搶渡，阮軍瓦解敗北。十九日，軍抵富良江，江之南岸即為安南首都黎城。此為黎城最后一道屏障。為阻止清軍過(guò)江，在清軍到達(dá)前，阮惠下令盡伐沿江竹木，并將沿江所有船只停泊南岸。清軍到達(dá)后，艱難覓得幾只小舟。夜幕降臨，載兵百余，駛向江心，奪得戰(zhàn)艦一只。許世亨親自率兵乘艦渡江，復(fù)奪得小舟三十余只，更番渡兵，分搗敵營(yíng)?；枰怪校钴姴槐娑喙?，驚慌潰逃，清軍焚其戰(zhàn)艦十余艘。二十日黎明，清軍全部過(guò)江。黎氏宗族、百姓出迎，匍匐道左。黎城不攻自潰，阮惠遁還廣南。是夜二鼓，黎維祁才走出藏身處所，趕赴軍營(yíng)進(jìn)見(jiàn)孫士毅。烏大經(jīng)所帶滇省官兵出關(guān)后，于十二月二十一日才行抵宣光，于此料理一、二日，亦即啟程前赴黎城。

在懸軍黎城階段，除孫士毅于十一月二十二日傳旨令黎維祁襲封安南國(guó)王，并知會(huì)廣西巡撫孫永清將黎維祁母妻眷屬送回安南，外其它則無(wú)大的舉動(dòng)。清軍在黎城按兵不動(dòng)達(dá)一個(gè)多月之久，最終由主動(dòng)變?yōu)楸粍?dòng)。

乾隆五十四年正月初一，軍中喝酒慶賀新年，當(dāng)天夜里忽報(bào)阮惠傾巢而至，清軍倉(cāng)促御敵。阮軍人數(shù)眾多，將粵兵四面密圍，且以大象馱載大炮猛攻，粵兵寡不敵眾，亂作一團(tuán)，黑夜中自相踐踏。黎維祁心膽俱裂，手抱年幼的孩子，隨同他的母親向北逃遁。滇師聽(tīng)聞炮聲震天，知道情況有變，也退走。孫士毅突出重圍，渡過(guò)富良江，人馬紛紛搶渡，把浮橋踩斷。于是尚在南岸御敵的提督許世亨、總兵張朝龍、尚維升等官兵血戰(zhàn)身歿。孫士毅逃回鎮(zhèn)南關(guān)，滇師因?yàn)橛欣枋系拇蟪键S文通做向?qū)?，于正月二十四日全師而返。安南之役以清朝的失敗而告結(jié)束。